地学基础实验教学中心经历了长期建设发展历程。1952年建院以来，以岩石学家董申保院士和穆克敏教授、构造地质学家张寿常教授、古生物学家俞建章教授、矿床学家张秋生和张贻侠教授为核心，亲手创建了岩石学、古生物学、构造地质学、矿床学等多个实验室，奠定了地学实验教学的坚实基础。1998年，地学院以原实验室为基础组建实验教学中心，实行主任负责制的统一管理。2001年10月，岩矿教学实验室通过了吉林省教育厅组织的“双基实验室”评估。2004年1月吉林大学设立地学基础实验教学中心，实行主任负责制的校、院两级管理体制；同年10月中心被吉林省教育厅评为首批“吉林省普通高校重点建设基础实验教学中心”。 2007年，吉林大学地学基础实验教学中心进入省级实验教学示范中心行列。2012年，岩石学实验室、构造地质学实验室等12个实验室主体搬迁至中心校区李四光实验楼，当年完成地质基础实验室建设，顺利开展实验教学工作。2014年，在“吉林大学基础与专业基础教学实验室评估”中评为“良好实验室”。2016年，在“吉林大学基础实验教学中心评估”中评为“优秀实验教学中心”教育部检查后获吉林大学先进集体。2020年，吉林大学实验管理处组织的实验室工作年度评估，中心成绩优秀；岩石学实验室获吉林大学实验室管理“党员示范岗”。

中心现有实验教师和实验技术人员65人，其中高级职称51人。其中校园内中心校区李四光实验楼及朝阳校区鸽子楼分布10个功能实验室及标本库，实验室面积1800余平方米，拥有教学标本50余万件，仪器设备（软件）296台件，设备总值865.72万元。兴城教学基地下辖4个功能实验室，实验技术人员和教师2人，实验室总面积950余平米，设备10台件，设备总价值100多万元。

中心每年承担着地学部14个相关专业1800余名学生的实验教学任务，近3年课程实验教学工作量年平均5.2万人时数，实习实践教学工作量年平均7.52万人时数（因疫情影响，平均人时数低于平均值）。

三年来，地学实验中心教师及技术人员承担教研项目34项，实验技术项目4项；教师承担科研项目80余项，总经费超过3721万元。发表SCI论文235篇，EI论文41篇。